五種致瀉性大腸埃希氏菌鑑定試劑盒PCR法
u 產品說明
五種致瀉性大腸埃希氏菌鑑定試劑盒PCR法可針對食品·✘▩◕╃、飼料等樣品中的致病微生物的特異核酸片段進行擴增│•☁,儀器實時監測擴增過程中的熒光訊號變化│•☁,自動判讀結果☁✘₪。本產品用於致瀉大腸埃希氏菌的檢測☁✘₪。檢出限為 103 CFU/ml☁✘₪。
◆ 產品組成(96 測試)
◆ 所需儀器
ABI │•☁,BioRad│•☁,TaKaRa 等 PCR 擴增儀│•☁,電泳儀│•☁,凝膠成像儀等電泳配套裝置☁✘₪。(使用熒光定量 PCR 儀進行定性判讀時則無需電泳裝置)
◆ 自備耗材和儀器
①滅菌 1.5mL 或 2.0mL 離心管;②冰盒;③移液器(0.5-10μL│•☁,10-100μL│•☁,100-1000μL)及配套滅菌吸頭;④ 離心機;⑤渦旋混勻器;⑥金屬浴☁✘₪。
◆ 樣品處理
參照《GB4789.6—2016 食品安全國家標準 食品微生物學檢驗致瀉大腸埃希氏菌檢驗》中的操作步驟進行前增菌☁✘₪。建議使用試劑配套細菌基因組 DNA 提取系列產品☁✘₪。
◆ 實驗操作
1.試劑配製(試劑配製區│•☁,放置於冰盒中進行)取出各管試劑│•☁,將試劑*解凍│•☁,離心 30s☁✘₪。取 12×(所待檢樣品數+3)的 PCR 反應管│•☁,按 12 個一組排列並編號│•☁,依次向各管中加入 23μL 的 12 種反應液☁✘₪。
2.新增模板(樣本製備區│•☁,放置於冰盒中進行)向每管反應液中分別加入 2μL 模板(或直接使用無菌吸頭挑取少許待檢菌落至反應管中)☁✘₪。加樣示例••╃││:(有 N 個待測樣品)
取(N+3)組 12 個一組的反應管│•☁,按順序第一組 12 管中全部加入 2μL 的 NG-DW│•☁,第二組 12管中全部加入 2μL的 NG-Ecoli│•☁,第三組 12 管中全部加入 2μL 的樣品 1 模板│•☁,第四組 12 管中全部加入 2μL 的樣品 2 模板│•☁,…│•☁,最後組 12 管中全部加入 2μL 的PG-Ecoli☁✘₪。
蓋好 PCR 管蓋後│•☁,渦旋混勻 30s│•☁,離心 1min│•☁,立即進行 PCR 擴增反應☁✘₪。
3.擴增反應(擴增及產物分析區)
按下列條件設定擴增反應••╃││:(如需使用熒光法進行檢測請選擇 FAM 通道)
PCR 迴圈 | 熒光收集位點 | ||
37℃ | 10 分鐘 | 1 個迴圈 | — |
95℃ | 10 分鐘 | 1 個迴圈 | — |
95℃ | 30 秒 |
30 個迴圈 | — |
63 ℃ | 30 秒 | — | |
72℃ | 90 秒 | ※ | |
72℃ | 5 分鐘 | 1 個迴圈 | — |
4.產物電泳(擴增及產物分析區)
稱量 4. 0g 瓊脂糖粉│•☁,加入至 200 mL 的 1×TAE 電泳緩衝液中│•☁,充分混勻☁✘₪。使用微波爐反覆加熱至沸騰│•☁,直到瓊脂糖粉*融化形成清亮透明的溶液☁✘₪。待瓊脂糖溶液冷卻至 60℃右時│•☁,加入溴化乙錠( EB )至終濃度為 0.5μg/mL│•☁, 充分混勻後│•☁,輕輕倒入已放置好梳子的模具中│•☁,凝膠長度要大於 10cm│•☁,厚度宜為 3mm~5mm☁✘₪。檢查梳齒下或梳齒間有無氣泡│•☁,用一次性吸頭小心排掉瓊脂糖凝膠中的氣泡☁✘₪。當瓊脂糖凝膠*凝結硬化後,輕輕拔出梳子│•☁,小心將膠塊和膠床放入電泳槽中│•☁,樣品孔放置在陰☁✘₪。向電泳槽中加入 1×TAE 電泳緩衝液│•☁,液麵高於膠面 1mm~2mm☁✘₪。將5μL PCR 產物與 1μL 6×上樣緩衝液混勻後│•☁,用微量移液器吸取混合液垂直伸入液麵下膠孔│•☁,小心上樣於孔中;陽性對照的 PCR 反應產物加入到最後一個泳道;第一個泳道中加入 2 μ L 分子量 Marker ☁✘₪。接通電泳儀電源│•☁,根據公式••╃││: 電壓=電泳槽正負極間的距離(cm)×5V/cm 計算並設定電泳儀電壓數值;啟動電壓開關│•☁,電泳開始以正負極鉑金絲出現氣泡為準☁✘₪。電泳 30min~45min 後│•☁,切斷電源☁✘₪。取出凝膠放入凝膠成像儀中觀察結果│•☁,拍照並記錄資料☁✘₪。
u 可使用 Gold view·✘▩◕╃、Gal-Rad 等等效的核酸熒光染料替代 EB☁✘₪。
u 推薦使用 DNA Marker••╃││:DL2000 或 100bp ladder│•☁,等可指示 100bp~1500bp 條帶的 Marker☁✘₪。
◆ 結果分析
1.陰陽性判讀••╃││:
進行電泳檢測時│•☁,需對比 Marker 進行判斷│•☁,當目的靶標對應位置出現單一顯著條帶時可判斷該靶標為陽性; 否則為該靶標檢測為陰性☁✘₪。(使用熒光定量 PCR 儀檢測時│•☁,檢測孔Ct≤30 時判斷該孔為陽性;當檢測孔Ct>30 時│•☁, 該檢測孔為陰性)
示例電泳圖
2.有效性判讀••╃││:
需同時滿足••╃││:1.空白對照中所有泳道均為陰性;2.陰性對照中 uidA 泳道陽性│•☁,其餘泳道陰性;2.陽性對照中所有泳道陽性│•☁,此時可判斷實驗有效☁✘₪。如無法滿足上述條件│•☁,則實驗無效│•☁,需重複實驗;如重複後結果仍為無效│•☁,請於本公司技術支援聯絡☁✘₪。
3.結果判讀••╃││:
在實驗有效的情況下│•☁,可根據下表進行判讀••╃││:
致瀉大腸埃希氏菌類別 | 目標條帶的種類組合 | |
EIEC | ipaH(+) |
uidA (+/-) |
EAEC | aggR│•☁,astA│•☁,pic 中一條或一條以上陽性 | |
EPEC | bfpB(+/-)│•☁,eae(+)│•☁,stx1(-)stx2│•☁,(-) | |
STEC/EHEC | stx1│•☁,stx2 中一條或一條以上陽性│•☁,eae(+/-)│•☁,bfpB(-) | |
ETEC | lt│•☁,stp│•☁,sth 中一條或以上陽性 |
u 97%以上大腸埃希氏菌為 uidA 陽性│•☁,可參考陰性對照中該基因檢測結果判斷擴增效果;
u 當結果判定為EPEC 陽性時│•☁,若 bfpB 靶標為陽性則說明樣品含有典型EPEC;若 bfpB 靶標為陰性則說明樣品為非典型EPEC;
當結果判定為STEC/EHEC 陽性時│•☁,若 eae 靶標為陽性則說明樣品含有典型EHEC;若 eae 靶標為陰性則說明樣品為非典型EHEC☁✘₪。